Początki klubu piłkarskiego w Wilkowie datuje się na końcówkę lat 50. ubiegłego wieku, jednak brakuje szczegółowych informacji.
Historia Wilkowianki jest bogata i ciekawa, lecz nie brakuje w niej bolesnych momentów. Klub największe sukcesy odnosił w latach 78-80, gdy awansował do Klasy Okręgowej, a dodatkowo stadion otrzymał nagrodę Najlepszego Obiektu Sportowego wśród wiejskich drużyn LZS.
Po spadku przyszły chude lata i sama Wilkowianka na kilka sezonów zawiesiła działalność.
Reaktywacja przyniosła kolejną promocję do okręgówki (sezon 98/99), a kolejny… kryzys nadszedł dekadę później, kiedy Wilkowianka spadła do B-klasy.
Na najniższym szczeblu w regionie nie zabawiła długo, już w pierwszym sezonie zdobywając awans. Od tego czasu Wilkowianka regularnie występuje w A-klasie, a sama filozofia budowy klubu uległa diametralnej zmianie.
Wilkowianka przecierała szlaki zarówno w rozwoju młodzieży jak i infrastruktury. Obecnie w wiejskim klubie trenuje blisko 150 dzieci, a malowniczo położony obiekt robi duże wrażenie na drużynach przyjezdnych.
